潔凈廠房建筑方式可分為土建結構和裝配式兩種，其中普遍采用裝配式。裝配式潔凈廠房系統主要由初，中，高三級空氣過濾的空調送風回風和 排風系統；動力及照明系統；工作環境參數的監測報警消防和通訊系統人流和物流系統；工藝管路系統；維護結構及靜電地面處理等各方面所要求的實施內容組成，形成空調凈化系統工程所包含的整個設備和器材的配套和建筑安裝內容。

無塵車間內的潔凈工作臺可根據產品要求或其他用途的要求，在操作臺上保持高潔凈度的局部凈化。潔凈工作臺可以在操作臺的局部空間形成無菌、無塵的局部凈化，其主要組成部件有預過濾器、過濾器、風機機組、外殼、靜壓箱、臺面和配套的電器元器件等。無塵車間的潔凈工作臺的構造要求：臺面，采用木質塑料貼面貼于層壓板上做成臺面，或采用不銹鋼做臺面；箱體，用熱扎薄鋼板與骨架氣焊易變形，可采用冷軋薄板折邊搭接，大電流電焊，內表面需粘貼消聲材料，尺寸應以通過一般房門為宜；箱體密封，所有縫隙均采用密封膠密封；操作區截面應盡可能與空氣過濾器送風截面相同，盡量減少盲區；風機、電機，選用高壓低噪的小型風機，風機與箱體的連接采用軟連接，電機及風機均應采取減振措施；燈罩，日光燈要盡量設置在燈罩內，燈罩內要通過潔凈氣流；預過濾器，須設置預過濾器，容量要大，在使用風量下，初阻力宜小于50Pa；過濾器，盡量采用大面積的過濾器，減少空氣過濾器的數量，過濾器與框架之間的密封應采用封導結合的雙環密封系統。

所謂無菌病房，換言之就是經過醫療凈化工程升級或建設的現代層流潔凈護理室，即是指通過層流凈化空調系統提供的無菌無塵化環境而用以收治因骨髓移植等極度低下患者的潔凈場所。雖然與平日里整天收治危重危急病人的潔凈手術室相比，其表面可能看似略顯平淡無常，但是實際上其每天亦在發揮著非常關鍵且意義重大的作用。

醫療凈化工程無菌病房(層流護理室)建設，日常于醫院之中主要用于預防性隔離，譬如接受過化學療法的白血病患者，惡性腫瘤經造成白血球減少的患者，再生不良性貧血造成的白血球減少的患者，接受臟器移植前后給予免疫抑制劑的患者，放射線傷害造成的白血球減少的患者以及免疫不全、嚴重、具有呼吸器官疾病的患者等。其目的在于預防被感染。