根據《招標投標法》相關規定，雖然承包人應發包人要求提交履約保函是應該的，但是承包人可以在保函形式和內容方面與發包人進行協商，增加索賠難度，制約發包人惡意索賠。承包人可以選擇有條件保函以保障自己的權益，且將條件明確約定在保函條款中。如果發包人堅持讓承包人提供無條件保函形式，則可以要求發包人拿出合法依據或者要求發包人提供支付工程款擔保。

承包人在不得不提供履約保函的情況下，應該爭取有利的保函條款。在實踐中，有以下要點需要注意：

，保函的有限期應為閉口形式，具體可約定為竣工之日或監理工程師簽發解除缺陷責任證書后的一個固定時間。

第二，索賠條款應約定發包人的書面索賠與擔保人付款之間有一定的間隔時間，以使承包人有足夠的時間與發包人談判，將爭端解決在擔保人賠付之前。

第三，在征得發包人認可的基礎上，履約保函的數額可隨工程進度的完成而遞減，擔保人在保函該減額時應及時提醒承包人辦理減額手續，一旦出現賠付，賠付的總金額不得超過擔保額。

第四，其他約定。如可約定在監理工程師頒發工程移交證書后，發包人同意用維修保函來代替履約保函;發包人不得將保函轉讓給第三方等等。

承包人接收到保函索賠通知后，應冷靜分析索賠原因，及時選擇合法途徑解決履約保函爭議。首先，應與保函當事人進行溝通。與發包人溝通，力爭消除雙方誤解，促使發包人撤回索賠文件或者放棄索賠權利。與擔保人溝通，要求擔保人嚴格審查索賠文件，合理謹慎地履行賠償義務。其次，以發包人為被告提起訴訟，并申請訴前或訴訟財產保全措施，請求法院裁定通知擔保人暫停保函項下賠付，待基礎合同糾紛解決后，視生效判決或裁定結果決定終是否賠付，以避免給擔保人或者承包人造成無法挽回的經濟損失。但由于我國現有法律并沒規定保函欺詐或不當索賠例外的規則，承包人只能依據民事訴訟法的相關規定提出上述請求，實踐中法院是否作出上述裁定，有待其具體裁量。

履約保證金強調的是保證招標方的利益或投資者的利益，這種保證既可由中標的承建商承擔，也可由第三方承擔，但須招標方認可方為有效，由此產生第三方承擔連帶責任，因此具有替代性。當中標人違約時，中標人的賠償責任由第三方承擔。 為了平衡招標方和中標方的利益，《工程建設項目施工招標投標辦法》第62條規定：“招標人要求中標人提交履約保證金或其他形式的履約擔保的，招標人應當同時向中標人提供工程款支付擔保。”