采用病原體防治白蟻可以取得較好的效果，可以利用蘇云金芽孢桿菌、銅綠假單孢桿菌、粘質沙雷氏菌防治白蟻。通過對多個白蟻種群的工蟻進行試驗，有關人員發現大約一個月內便可 消除白蟻，效果非常明顯。

病毒

采用病毒方式防治白蟻的案例并不多，但采用宿主之間傳播的方式，病毒可以很好地滿足相關要求。當前，利用病毒防治白蟻只局限于實驗室，還沒有應用到實際環境中，而且病毒還有自身缺陷，會受到環境中溫度和濕度方面的影響，病毒的繁殖還會受到活體宿主的制約，防治成本比較高，這一方法不適合大范圍使用 。

利用防治白蟻的研究較多，在最近幾十年白蟻的防治工作中，與這一方法有關的資料可達 65%。當前，已有 22 種可以作為白蟻專性外寄生物，不少于 20 種對白蟻具有致病性作用。國內危害的是土棲白蟻，很多研究表明，金龜子綠僵菌可以使白蟻致病，接觸 5～35 min 后，白蟻種群的死亡率為 85%；如果接觸時間達到 40 min，白蟻死亡率可上升到 ；如果接觸時間再延長，白蟻則會在 1 d 內完全消亡 。球孢白僵菌則對白蟻沒有較大的影響。

線蟲

在 20 世紀初，研究人員在臺灣乳白蟻的頭部發現了線蟲，對白蟻具有較強的致病作用，所以在 20 世紀 30 年代開展了利用線蟲防治白蟻方面的研究。世界范圍內開展的線蟲防治白蟻的研究和應用較多，但是見效比較慢，應用起來也比較復雜，干木白蟻和木杠白蟻的野外防治效果有限。

國內采用防治白蟻時，多采用阿維菌素和衍生伊維菌素。阿維菌素最早用于對寄生線蟲的防治。在室內試驗時，采用濃度為 20 mg/kg 的阿維菌素可消滅白蟻，用藥后的 4～5 d 是白蟻死亡的高峰期，死亡率為 32%，每只白蟻接觸 0.031 2 滋g 的劑量就會使白蟻出現半致死效果，不會對自然環境產生污染。伊維菌素用于臺灣乳白蟻、黃胞散白蟻的防治試驗中，當溶液濃度達到 25 mg/L，就具備較好的殺蟲效果。當濃度為 100 mg/L 時，24 h 后白蟻的死亡率可達到 。這一試驗在野外的應用較少，必須采用較高的劑量，并進行密封處理才可以有效穿透白蟻，而有效的濃度會比室內試驗條件下高出許多。